Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3KRW8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3KRW8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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