Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCSO14618 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSO14618 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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