Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHMG1C9JSJ3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHMG1C9JSJ3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms