Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RRN3P1Q2M238 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RRN3P1Q2M238 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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