Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFLP07196 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEFLP07196 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEFLP07196 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEFLP07196 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEFLP07196 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEFLP07196 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFLP07196 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEFLP07196 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms