Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARL2-SNX15V9GYD0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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