Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LYVE1Q9Y5Y7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYVE1Q9Y5Y7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms