Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX5Q9Y5X3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX5Q9Y5X3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX5Q9Y5X3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms