Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMED3Q9Y3Q3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED3Q9Y3Q3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms