Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPS28Q9Y2Q9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPS28Q9Y2Q9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPS28Q9Y2Q9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms