Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA2Q9UM44 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA2Q9UM44 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HHLA2Q9UM44 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms