Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM4Q9UKN5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM4Q9UKN5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM4Q9UKN5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRDM4Q9UKN5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM4Q9UKN5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms