Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHF11Q9UIL8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF11Q9UIL8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF11Q9UIL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms