Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NDE1Q9NXR1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDE1Q9NXR1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDE1Q9NXR1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDE1Q9NXR1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDE1Q9NXR1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms