Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC2Q9NRP2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMC2Q9NRP2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMC2Q9NRP2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMC2Q9NRP2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMC2Q9NRP2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMC2Q9NRP2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMC2Q9NRP2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMC2Q9NRP2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMC2Q9NRP2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMC2Q9NRP2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMC2Q9NRP2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMC2Q9NRP2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMC2Q9NRP2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms