Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCC2Q9HCC0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCCC2Q9HCC0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms