Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP4Q9BWG4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP4Q9BWG4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.1 ms