Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM7Q9BQ49 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM7Q9BQ49 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms