Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf85Q96MD7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf85Q96MD7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms