Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD8Q96LT4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD8Q96LT4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD8Q96LT4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms