Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R17PQ8TDU5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R17PQ8TDU5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R17PQ8TDU5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R17PQ8TDU5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms