Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPRQ8TBG9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNPRQ8TBG9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNPRQ8TBG9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPRQ8TBG9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms