Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPC24Q8NBT2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPC24Q8NBT2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SPC24Q8NBT2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPC24Q8NBT2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPC24Q8NBT2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms