Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8F6

YIPF7, Protein YIPF7, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF7Q8N8F6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF7Q8N8F6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YIPF7Q8N8F6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YIPF7Q8N8F6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF7Q8N8F6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YIPF7Q8N8F6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YIPF7Q8N8F6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YIPF7Q8N8F6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF7Q8N8F6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF7Q8N8F6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF7Q8N8F6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF7Q8N8F6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF7Q8N8F6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF7Q8N8F6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF7Q8N8F6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF7Q8N8F6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms