Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC17Q8N6Y2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC17Q8N6Y2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms