Protein–RNA interactions for Protein: Q8N535

LINC00471, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00471, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00471Q8N535 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00471Q8N535 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00471Q8N535 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00471Q8N535 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00471Q8N535 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms