Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NINQ8N4C6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NINQ8N4C6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NINQ8N4C6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINQ8N4C6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms