Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYS1Q717R9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYS1Q717R9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYS1Q717R9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CYS1Q717R9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYS1Q717R9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms