Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SRCAPQ6ZRS2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SRCAPQ6ZRS2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SRCAPQ6ZRS2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SRCAPQ6ZRS2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SRCAPQ6ZRS2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SRCAPQ6ZRS2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SRCAPQ6ZRS2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SRCAPQ6ZRS2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SRCAPQ6ZRS2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SRCAPQ6ZRS2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SRCAPQ6ZRS2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SRCAPQ6ZRS2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SRCAPQ6ZRS2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SRCAPQ6ZRS2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SRCAPQ6ZRS2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SRCAPQ6ZRS2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SRCAPQ6ZRS2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SRCAPQ6ZRS2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SRCAPQ6ZRS2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SRCAPQ6ZRS2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SRCAPQ6ZRS2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SRCAPQ6ZRS2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SRCAPQ6ZRS2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms