Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCBE1Q6UXH8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCBE1Q6UXH8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCBE1Q6UXH8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms