Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A4Q6P1M0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A4Q6P1M0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A4Q6P1M0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms