Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIGD3Q6B0B8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIGD3Q6B0B8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TIGD3Q6B0B8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIGD3Q6B0B8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms