Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OTUD3Q5T2D3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD3Q5T2D3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD3Q5T2D3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms