Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COLEC12Q5KU26 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COLEC12Q5KU26 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLEC12Q5KU26 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315.1 ms