Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RTL5Q5HYW3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RTL5Q5HYW3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTL5Q5HYW3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RTL5Q5HYW3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms