Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGGHGQ32M88 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGGHGQ32M88 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGGHGQ32M88 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms