Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM16LQ309B1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM16LQ309B1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM16LQ309B1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM16LQ309B1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms