Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC18A3Q16572 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC18A3Q16572 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC18A3Q16572 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC18A3Q16572 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
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