Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC3Q15034 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HERC3Q15034 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC3Q15034 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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