Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDE6HQ13956 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE6HQ13956 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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