Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 YKL053WYKL053W 375 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 LSR1LSR1 1175 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 COS10YNR075W 1125 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 UFD1YGR048W 1086 nt8.36□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 RPR1RPR1 369 nt8.35□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 MIM1YOL026C 342 nt8.35□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 TOM71YHR117W 1920 nt8.35□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 ARO7YPR060C 771 nt8.34□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 KGD2YDR148C 1392 nt8.34□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 RPD3YNL330C 1302 nt8.33□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 RRT14YIL127C 621 nt8.33□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 YLR046CYLR046C 813 nt8.32□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 YPT11YNL304W 1254 nt8.32□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 DLD3YEL071W 1491 nt8.32□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 SUV3YPL029W 2214 nt8.31□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 FIT1YDR534C 1587 nt8.31□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 NUP53YMR153W 1428 nt8.31□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 FET5YFL041W 1869 nt8.31□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 FRA1YLL029W 2250 nt8.3□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 CAK1YFL029C 1107 nt8.3□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 SAN1YDR143C 1833 nt8.29□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 HBS1YKR084C 1836 nt8.29□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 TDH1YJL052W 999 nt8.29□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 YBL095WYBL095W 813 nt8.29□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 RPS6AYPL090C 711 nt8.29□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 RPS6BYBR181C 711 nt8.29□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 snR31snR31 225 nt8.28□□□□□ -1.08
SGO1Q08490 MAS1YLR163C 1389 nt8.27□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.27□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 BXI1YNL305C 894 nt8.27□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 CRC1YOR100C 984 nt8.27□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 LPD1YFL018C 1500 nt8.27□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 ITR2YOL103W 1830 nt8.26□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 RSM7YJR113C 744 nt8.26□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 NSG2YNL156C 900 nt8.26□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 DUR3YHL016C 2208 nt8.26□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 HAP5YOR358W 729 nt8.25□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 OCH1YGL038C 1443 nt8.25□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 YPR084WYPR084W 1371 nt8.24□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 DUS3YLR401C 2007 nt8.24□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 DPL1YDR294C 1770 nt8.24□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 YMR265CYMR265C 1386 nt8.23□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 RSC4YKR008W 1878 nt8.23□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 LEU4YNL104C 1860 nt8.21□□□□□ -1.09
SGO1Q08490 RPC31YNL151C 756 nt8.21□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 ATP2YJR121W 1536 nt8.2□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 INH1YDL181W 258 nt8.2□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 NPP2YEL016C 1482 nt8.19□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 GAS1YMR307W 1680 nt8.18□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 PUP2YGR253C 783 nt8.18□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 YLR460CYLR460C 1131 nt8.18□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 MET22YOL064C 1074 nt8.18□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 PTC6YCR079W 1329 nt8.18□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 RPN14YGL004C 1254 nt8.17□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 RRT6YGL146C 936 nt8.17□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 YLR358CYLR358C 564 nt8.17□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 ALR1YOL130W 2580 nt8.16□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 YDR476CYDR476C 675 nt8.16□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 YML079WYML079W 606 nt8.16□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 DOC1YGL240W 753 nt8.15□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 CHS7YHR142W 951 nt8.15□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 YIL168WYIL168W 384 nt8.15□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 URA1YKL216W 945 nt8.15□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 VMA11YPL234C 495 nt8.15□□□□□ -1.1
SGO1Q08490 snR4snR4 186 nt8.14□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 ORT1YOR130C 879 nt8.13□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 PDC6YGR087C 1692 nt8.13□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 TRP2YER090W 1524 nt8.13□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 NAS6YGR232W 687 nt8.12□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 SPG1YGR236C 288 nt8.12□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 YPL041CYPL041C 624 nt8.12□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 SNX3YOR357C 489 nt8.11□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 HXT11YOL156W 1704 nt8.11□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 KRR1YCL059C 951 nt8.09□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 SBP1YHL034C 885 nt8.09□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 RNA170RNA170 169 nt8.09□□□□□ -1.11
SGO1Q08490 THI6YPL214C 1623 nt8.08□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 RTG2YGL252C 1767 nt8.08□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 MET30YIL046W 1923 nt8.08□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 LCP5YER127W 1074 nt8.08□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 HAC1YFL031W 717 nt8.08□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 COG1YGL223C 1254 nt8.08□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 ADE16YLR028C 1776 nt8.07□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.07□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.07□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 SRY1YKL218C 981 nt8.07□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 OLA1YBR025C 1185 nt8.07□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 SRM1YGL097W 1449 nt8.06□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 YPT31YER031C 672 nt8.06□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 YJL144WYJL144W 315 nt8.06□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 YOR111WYOR111W 699 nt8.06□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 PSP2YML017W 1782 nt8.06□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 YDR306CYDR306C 1437 nt8.05□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 LAT1YNL071W 1449 nt8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms