Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABPB1Q06547 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GABPB1Q06547 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GABPB1Q06547 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABPB1Q06547 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms