Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 SEN2YLR105C 1134 nt7.68□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 EHT1YBR177C 1356 nt7.68□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 INO1YJL153C 1602 nt7.67□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 YCR025CYCR025C 411 nt7.67□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 PDC6YGR087C 1692 nt7.67□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 MRN1YPL184C 1839 nt7.66□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 DIP5YPL265W 1827 nt7.66□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 GLY1YEL046C 1164 nt7.66□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 TIF3YPR163C 1311 nt7.66□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 NDE2YDL085W 1638 nt7.65□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 SER2YGR208W 930 nt7.65□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 OLA1YBR025C 1185 nt7.65□□□□□ -1.18
YHC1Q05900 ADE16YLR028C 1776 nt7.64□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 OCH1YGL038C 1443 nt7.64□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 POP2YNR052C 1302 nt7.64□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 PAU19YMR325W 375 nt7.64□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 YNL140CYNL140C 570 nt7.64□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 TGL5YOR081C 2250 nt7.63□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 YGR210CYGR210C 1236 nt7.62□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 TDA4YJR116W 840 nt7.62□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 YMR166CYMR166C 1107 nt7.62□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 HTS1YPR033C 1641 nt7.61□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 CAK1YFL029C 1107 nt7.61□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 INM1YHR046C 888 nt7.61□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 FIT1YDR534C 1587 nt7.61□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 WSC4YHL028W 1818 nt7.61□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 ALR1YOL130W 2580 nt7.6□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 LPD1YFL018C 1500 nt7.59□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 UFD1YGR048W 1086 nt7.59□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 RCF1YML030W 480 nt7.59□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 RHO1YPR165W 630 nt7.59□□□□□ -1.19
YHC1Q05900 SHC1YER096W 1539 nt7.58□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.58□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.58□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.58□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.58□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.58□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 YPL108WYPL108W 507 nt7.58□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 ARO3YDR035W 1113 nt7.57□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 PUP3YER094C 618 nt7.57□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 HXT8YJL214W 1710 nt7.56□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 BSP1YPR171W 1731 nt7.56□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 MDH2YOL126C 1134 nt7.56□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 LSP1YPL004C 1026 nt7.56□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 WSC3YOL105C 1671 nt7.56□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 ALG7YBR243C 1347 nt7.55□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 TOM71YHR117W 1920 nt7.55□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 RRT14YIL127C 621 nt7.55□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 NAP1YKR048C 1254 nt7.55□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 MRP7YNL005C 1116 nt7.55□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 PFS2YNL317W 1398 nt7.55□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 THI73YLR004C 1572 nt7.54□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 PMT7YDR307W 1989 nt7.53□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 SWM1YDR260C 513 nt7.53□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 KTR4YBR199W 1395 nt7.53□□□□□ -1.2
YHC1Q05900 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.52□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 MET13YGL125W 1803 nt7.51□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.51□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 YGR137WYGR137W 375 nt7.51□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 HSV2YGR223C 1347 nt7.51□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 PUP1YOR157C 786 nt7.5□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 FCY1YPR062W 477 nt7.5□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.5□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.5□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.5□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 PMT1YDL095W 2454 nt7.5□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 PET18YCR020C 648 nt7.49□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 ELP6YMR312W 822 nt7.49□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 YPT31YER031C 672 nt7.48□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 SAM50YNL026W 1455 nt7.48□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 TIM50YPL063W 1431 nt7.47□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 BXI1YNL305C 894 nt7.47□□□□□ -1.21
YHC1Q05900 SLM3YDL033C 1254 nt7.46□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 SNP1YIL061C 903 nt7.46□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 YJL160CYJL160C 864 nt7.46□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 SLG1YOR008C 1137 nt7.46□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 TPO1YLL028W 1761 nt7.46□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 YCP4YCR004C 744 nt7.45□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 YER156CYER156C 1017 nt7.45□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 PRE10YOR362C 867 nt7.45□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 FRA1YLL029W 2250 nt7.45□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 MTC6YHR151C 1581 nt7.45□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 JHD1YER051W 1479 nt7.44□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 RPS6AYPL090C 711 nt7.44□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 RPS6BYBR181C 711 nt7.44□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.43□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 SGF73YGL066W 1974 nt7.41□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 CDA1YLR307W 906 nt7.41□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 AVL9YLR114C 2295 nt7.41□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 ATP2YJR121W 1536 nt7.4□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 HEM14YER014W 1620 nt7.4□□□□□ -1.22
YHC1Q05900 PDC5YLR134W 1692 nt7.39□□□□□ -1.23
YHC1Q05900 ARG7YMR062C 1326 nt7.39□□□□□ -1.23
YHC1Q05900 CKB1YGL019W 837 nt7.39□□□□□ -1.23
YHC1Q05900 PMU1YKL128C 888 nt7.39□□□□□ -1.23
YHC1Q05900 YMR007WYMR007W 381 nt7.39□□□□□ -1.23
YHC1Q05900 TES1YJR019C 1050 nt7.38□□□□□ -1.23
YHC1Q05900 PEX28YHR150W 1740 nt7.38□□□□□ -1.23
YHC1Q05900 MET30YIL046W 1923 nt7.37□□□□□ -1.23
YHC1Q05900 YPR084WYPR084W 1371 nt7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 353.1 ms