Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPM4P67936 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPM4P67936 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPM4P67936 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPM4P67936 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPM4P67936 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPM4P67936 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPM4P67936 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPM4P67936 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPM4P67936 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPM4P67936 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPM4P67936 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPM4P67936 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPM4P67936 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPM4P67936 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPM4P67936 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPM4P67936 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPM4P67936 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPM4P67936 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPM4P67936 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPM4P67936 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPM4P67936 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPM4P67936 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPM4P67936 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TPM4P67936 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPM4P67936 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPM4P67936 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPM4P67936 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPM4P67936 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPM4P67936 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPM4P67936 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPM4P67936 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPM4P67936 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPM4P67936 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPM4P67936 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPM4P67936 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPM4P67936 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TPM4P67936 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TPM4P67936 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPM4P67936 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPM4P67936 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPM4P67936 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPM4P67936 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM4P67936 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM4P67936 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM4P67936 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM4P67936 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM4P67936 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM4P67936 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM4P67936 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM4P67936 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPM4P67936 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPM4P67936 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPM4P67936 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPM4P67936 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPM4P67936 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPM4P67936 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPM4P67936 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPM4P67936 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPM4P67936 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPM4P67936 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPM4P67936 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPM4P67936 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPM4P67936 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPM4P67936 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPM4P67936 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPM4P67936 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPM4P67936 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM4P67936 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM4P67936 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM4P67936 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM4P67936 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM4P67936 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM4P67936 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM4P67936 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM4P67936 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPM4P67936 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPM4P67936 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPM4P67936 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPM4P67936 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPM4P67936 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TPM4P67936 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPM4P67936 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPM4P67936 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPM4P67936 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPM4P67936 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPM4P67936 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPM4P67936 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TPM4P67936 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPM4P67936 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPM4P67936 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPM4P67936 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPM4P67936 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPM4P67936 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM4P67936 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM4P67936 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM4P67936 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM4P67936 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM4P67936 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM4P67936 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms