Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRPNP63162 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPNP63162 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms