Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00205P59089 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00205P59089 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00205P59089 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms