Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMDP50402 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMDP50402 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMDP50402 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMDP50402 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMDP50402 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMDP50402 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMDP50402 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMDP50402 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMDP50402 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMDP50402 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMDP50402 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMDP50402 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMDP50402 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMDP50402 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMDP50402 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMDP50402 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMDP50402 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMDP50402 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMDP50402 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMDP50402 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMDP50402 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMDP50402 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMDP50402 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMDP50402 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMDP50402 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMDP50402 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMDP50402 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMDP50402 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMDP50402 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMDP50402 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMDP50402 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMDP50402 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMDP50402 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMDP50402 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMDP50402 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EMDP50402 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMDP50402 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMDP50402 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMDP50402 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMDP50402 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMDP50402 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMDP50402 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMDP50402 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMDP50402 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMDP50402 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMDP50402 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMDP50402 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMDP50402 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMDP50402 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMDP50402 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMDP50402 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMDP50402 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EMDP50402 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMDP50402 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMDP50402 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EMDP50402 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMDP50402 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMDP50402 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMDP50402 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMDP50402 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMDP50402 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMDP50402 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EMDP50402 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMDP50402 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMDP50402 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMDP50402 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EMDP50402 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMDP50402 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMDP50402 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMDP50402 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMDP50402 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMDP50402 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EMDP50402 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMDP50402 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMDP50402 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMDP50402 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMDP50402 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMDP50402 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMDP50402 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMDP50402 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMDP50402 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMDP50402 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMDP50402 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMDP50402 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EMDP50402 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMDP50402 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMDP50402 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMDP50402 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMDP50402 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMDP50402 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMDP50402 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMDP50402 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMDP50402 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMDP50402 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMDP50402 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMDP50402 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMDP50402 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMDP50402 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMDP50402 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms