Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP13P45452 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP13P45452 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP13P45452 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP13P45452 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP13P45452 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP13P45452 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP13P45452 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP13P45452 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP13P45452 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP13P45452 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MMP13P45452 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MMP13P45452 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MMP13P45452 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP13P45452 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP13P45452 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP13P45452 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP13P45452 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP13P45452 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP13P45452 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP13P45452 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP13P45452 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP13P45452 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP13P45452 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP13P45452 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP13P45452 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP13P45452 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP13P45452 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP13P45452 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP13P45452 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP13P45452 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP13P45452 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP13P45452 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP13P45452 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP13P45452 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP13P45452 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP13P45452 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP13P45452 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP13P45452 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP13P45452 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP13P45452 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP13P45452 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP13P45452 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP13P45452 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP13P45452 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP13P45452 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP13P45452 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP13P45452 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP13P45452 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP13P45452 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP13P45452 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP13P45452 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MMP13P45452 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MMP13P45452 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP13P45452 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP13P45452 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP13P45452 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP13P45452 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP13P45452 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP13P45452 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP13P45452 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP13P45452 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP13P45452 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP13P45452 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP13P45452 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP13P45452 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP13P45452 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP13P45452 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP13P45452 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP13P45452 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP13P45452 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP13P45452 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP13P45452 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP13P45452 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP13P45452 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP13P45452 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP13P45452 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP13P45452 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP13P45452 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP13P45452 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP13P45452 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP13P45452 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP13P45452 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP13P45452 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP13P45452 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP13P45452 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP13P45452 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP13P45452 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP13P45452 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP13P45452 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP13P45452 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP13P45452 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP13P45452 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MMP13P45452 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MMP13P45452 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MMP13P45452 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MMP13P45452 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MMP13P45452 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MMP13P45452 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MMP13P45452 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms