Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX1P40424 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX1P40424 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX1P40424 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX1P40424 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PBX1P40424 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PBX1P40424 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX1P40424 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX1P40424 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PBX1P40424 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBX1P40424 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBX1P40424 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PBX1P40424 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBX1P40424 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBX1P40424 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBX1P40424 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBX1P40424 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBX1P40424 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBX1P40424 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBX1P40424 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBX1P40424 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PBX1P40424 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX1P40424 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX1P40424 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX1P40424 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PBX1P40424 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PBX1P40424 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBX1P40424 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBX1P40424 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBX1P40424 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBX1P40424 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX1P40424 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX1P40424 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX1P40424 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX1P40424 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX1P40424 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX1P40424 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX1P40424 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX1P40424 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX1P40424 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX1P40424 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX1P40424 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBX1P40424 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBX1P40424 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX1P40424 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX1P40424 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX1P40424 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PBX1P40424 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBX1P40424 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX1P40424 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX1P40424 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX1P40424 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX1P40424 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX1P40424 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX1P40424 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX1P40424 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX1P40424 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX1P40424 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX1P40424 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX1P40424 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX1P40424 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX1P40424 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX1P40424 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX1P40424 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX1P40424 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX1P40424 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX1P40424 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PBX1P40424 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX1P40424 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX1P40424 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBX1P40424 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX1P40424 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX1P40424 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX1P40424 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX1P40424 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX1P40424 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX1P40424 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX1P40424 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PBX1P40424 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PBX1P40424 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PBX1P40424 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX1P40424 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX1P40424 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX1P40424 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PBX1P40424 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PBX1P40424 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PBX1P40424 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PBX1P40424 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PBX1P40424 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBX1P40424 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBX1P40424 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBX1P40424 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBX1P40424 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBX1P40424 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBX1P40424 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX1P40424 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX1P40424 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX1P40424 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBX1P40424 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBX1P40424 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms