Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2IP36954 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2IP36954 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2IP36954 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2IP36954 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2IP36954 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms